Alapítás 1929.
Dr.Polyák Károly hittanár alapította először Szegeden a Polgár utca-Boromei Szent Károly Irgalomházat. Páli Szt.Vincés Rend irgalmas nővérek látták el a gyermekeket, a létfenntartást adományokból oldották meg, orvosi ellátás nem volt.
1946 -Flögl Ilona – főnökasszony.lett kinevezve, ekkor lettek először kinevezett dolgozók.
1950 -Eü. Minisztérium megalakult, államositás 1951–ben új név:: Állami Egészségügyi Gyermekotthon, 1954-ig újszegedi gyermekkórház kihelyezett részlege
1960 ásotthalmi határőrlaktanyából –gyerekotthon létesült 100 férőhellyel
1964. Dr. Waltner Károly fia elhunyt 200e.---összeg felajánlás történt emelet építés
1965. 250 főre emelkedik a létszám, egyesítik Ásotthalommal.
1966. Megyei Városi Tanács - Eü. Osztálya veszi át a felügyeletet.
1986. új pavilon építése Szegeden. -a két telephelyen: 280 fő
1991-ben ásotthalmi részleget felszámolják, eng.létszám 200 fő.
1994-ben az intézmény a Dr.Waltner Károly Egészségügyi Gyermekotthon nevet vette fel.
2000. Dr.Waltner Károly Otthon
2013: Szociális és Gyermekvédelmi Főigazgatóság fenntartása alá kerül az intézmény.
2016. Szegedi Dr. Waltner Károly Otthon integrált intézménybe Csongrád megye (2020. június 4-től Csongrád-Csanád megyére változott a megye neve) területéről gyermekvédelmi részlegek csatolása történik.